Naming of arrays and comparisons

فهرست عناوین اصلی در این پاورپوینت

فهرست عناوین اصلی در این پاورپوینت

● Guide to the SIPAGENE DataBase
● Access to SIPAGENE
● Overview
● Naming of arrays and comparisons
● First steps:
Main page after login
● change your password
● Group comparisons
● Perform a
group comparison
● Search for existing group comparisons
● Get experiment information for group comparisons
● Define a selection of group comparisons for subsequent analysis
● Search for candidate genes:
1. Select an existing group comparison
● Search for candidate genes:
2. Define the selection criteria
● View and download results of a query
● Details for a selected probe set
● Queries from multiple group comparisons
● How to share data
● Define sharing rights
● Administration of your own group comparisons

نوع زبان: انگلیسی حجم: 2.74 مگا بایت
نوع فایل: اسلاید پاورپوینت تعداد اسلایدها: 19 صفحه
سطح مطلب: نامشخص پسوند فایل: ppt
گروه موضوعی: زمان استخراج مطلب: 2019/06/14 11:44:43

لینک دانلود رایگان لینک دانلود کمکی

اسلایدهای پاورپوینت مرتبط در پایین صفحه

عبارات مهم استفاده شده در این مطلب

عبارات مهم استفاده شده در این مطلب

comparison, group, select, selection, array, ., experiment, rights, „, baseline, click, confirm,

توجه: این مطلب در تاریخ 2019/06/14 11:44:43 به صورت خودکار از فضای وب آشکار توسط موتور جستجوی پاورپوینت جمع آوری شده است و در صورت اعلام عدم رضایت تهیه کننده ی آن، طبق قوانین سایت از روی وب گاه حذف خواهد شد. این مطلب از وب سایت زیر استخراج شده است و مسئولیت انتشار آن با منبع اصلی است.

http://www.bioretis-analysis.de/sipagene/public/introduction/guide.ppt

در صورتی که محتوای فایل ارائه شده با عنوان مطلب سازگار نبود یا مطلب مذکور خلاف قوانین کشور بود لطفا در بخش دیدگاه (در پایین صفحه) به ما اطلاع دهید تا بعد از بررسی در کوتاه ترین زمان نسبت به حدف با اصلاح آن اقدام نماییم. جهت جستجوی پاورپوینت های بیشتر بر روی اینجا کلیک کنید.

عبارات پرتکرار و مهم در این اسلاید عبارتند از: comparison, group, select, selection, array, ., experiment, rights, „, baseline, click, confirm,

مشاهده محتوای متنیِ این اسلاید ppt

مشاهده محتوای متنیِ این اسلاید ppt

guide to the sipagene database access to sipagene goto https www.sipagene.de ۲ enter your user name ۳ enter your password ۴ click on login navigation bar to select individual areas for login generating a personal account login as anonymous public user introduction contact information ۱ first register for a private login and receive a password by e mail overview perform new group comparisons analysis of single group comparison analysis of multiple group comparison change password sharing select experiment group select baseline group select individual arrays initiate comparison select group comparison select search parameters get list of candidate genes view results of individual genes select combinations of group comparison search parameters and output parameters get list of candidate genes view results of individual genes select the investigator who shall get access to your comparison select group comparisons and sharing conditions activate your selection of sharing conditions enter new password and confirm select comparisons of interest naming of arrays and comparisons example for a group nd pbmc lps ۴h ۱۳۳a example for a comparison spl ۲۸ nd ۱ ۲ ۳ pbmc lps ۴h vs nd ۱ ۲ ۳ pbmc lps h ۱۳۳a with samples ۱ to ۳ of each group user spl sipagene public library comparison number of user spl ۲۸ arrays of the experiment group arrays of the baseline group arrays type first steps main page after login navigation panel change your password ۱ click on „rights to change your password or to manage sharing rights for access to your data ۲ click here to change your password ۳ enter your old and new password ۴ click here to confirm group comparisons definitions the order of a comparison is important and is pre defined by the order of the pairwise comparisons. experiment chips ec are compared to baseline chips bc . if experiment chips present higher expression levels than baseline chips the signal log ratio and the fold change values are positive otherwise both are negative. you may not change this order but you can always retrieve for decreased expression by using the negative values. perform a group comparison ۱ select the experiment group ۲ confirm your selection and go to the baseline selection ۳ select the baseline group ۵ select at least two or more arrays of the experiment group ۶ select at least two or more arrays of the baseline group ۷ start comparison ۴ confirm and go to the selection of individual arrays access to arrays of the experiment and baseline group is restricted by ownership and sharing rights search for existing group comparisons ۲ confirm your selection ۱ enter your keyword into global search any specific field or select a description from one of the drop down menues get experiment information for group comparisons ۲ for individual arrays a short description is provided ۱ the name of the group comparison provides abbreviated information about donor tissue stimulus kinetics and array type of the experiment group and the baseline group ۳ extended information is accessible from the public repositories by clicking on the accession number for the array or the experiment define a selection of group comparisons for subsequent analysis ۱ individual comparisons may be selected for further analysis ۲ a pre selection of comparisons may be defined that will be listed in the subsequent menus of comparisons search for candidate genes ۱. select an existing group comparison ۱ this menu shows the comparisons that you have selected and that you are allowed to access ۲ you may change your selection if needed ۳ click „next to confirm and start a query search for candidate genes ۲. define the selection criteria ۱ select pre defined search criteria optimized criteria to select for „true positives or enter values for any parameter or combination of parameters ۲ criteria in the same column are „and selections to combine with „or or „not select the next column and the appropriate operator parameters of the experiment chips ec name of the comparison fold change and signal log ratio change call of all pairwise comparisons between ec versus bc or within each group p values of the t tests when applying signals or signal log ratios ۳ start your retrieval parameters of the baseline chips bc the „mouse over function describes the parameter view and download results of a query affymetrix probe sets identified not sorted ۱ you may download the summary of the group comparison or the list of signals of each individual gene and array for further analysis like clustering ۲ click here to see the entrezgene information of the gene ۳ click on a probe set id to see the details of the results for this probe set details for a selected probe set signals of each experiment chip go to the „entrez gene information for this probe set signals of each baseline chip details of the statistical results for each group comparison your selection criteria the „mouse over function describes each parameter queries from multiple group comparisons ۱ go to multiple group comparison ۲ select group comparisons ۳ select search parameters ۴ enter search criteria ۶ select „and or not operator ۵ select comparison for display of results ۷ start query result list of selected probe sets how to share data ۱ click on „rights to manage sharing rights for access to your data ۲ select your collaboration partner ۳ confirm your selection define sharing rights after you confirmed the selected investigator you will find all your comparisons in this table ۱ select one of the following levels of sharing rights no rights to deny access to this comparison. read results to permit analysis of this comparison. right to analyze to perform new comparisons of sub selections of arrays from this comparison. give rights … to permit further distribution of rights to access the selected comparison. the owner may always revoke any sharing rights. ۲ confirm your selection of rights administration of your own group comparisons ۱ click here to display all your group comparisons please administrate your group comparisons regularly to avoid overload of the database. keep only those that are essential avoid unnecessary redundancy and delete outdated subgroup analyses. this will help to keep retrieval time as short as possible ۳ confirm your decision and delete this group comparison or go back and keep this group comparison ۲ select the group comparison you want to delete …

کلمات کلیدی پرکاربرد در این اسلاید پاورپوینت: comparison, group, select, selection, array, ., experiment, rights, „, baseline, click, confirm,

این فایل پاورپوینت شامل 19 اسلاید و به زبان انگلیسی و حجم آن 2.74 مگا بایت است. نوع قالب فایل ppt بوده که با این لینک قابل دانلود است. این مطلب برگرفته از سایت زیر است و مسئولیت انتشار آن با منبع اصلی می باشد که در تاریخ 2019/06/14 11:44:43 استخراج شده است.

http://www.bioretis-analysis.de/sipagene/public/introduction/guide.ppt

  • جهت آموزش های پاورپوینت بر روی اینجا کلیک کنید.
  • جهت دانلود رایگان قالب های حرفه ای پاورپوینت بر روی اینجا کلیک کنید.

رفتن به مشاهده اسلاید در بالای صفحه


پاسخی بگذارید

نشانی ایمیل شما منتشر نخواهد شد. بخش‌های موردنیاز علامت‌گذاری شده‌اند *