Shared memory v.s. distributed memory

فهرست عناوین اصلی در این پاورپوینت

فهرست عناوین اصلی در این پاورپوینت

● Shared memory v.s. distributed memory
● R: HPC Matters
● R in parallel: R basics
● Useful R commands and variables
● R: memory profiling
● R: memory profiling with lineprof
● Speed up R code: Rprof
● How to Speed up R code
● Speed up R code:vectors
● Speed up R code: vectors, matrices, and tables vs. loops, dataframes, and lists
● Speed up R code: vectors, matrices, and tables
● How to Speed up R code
● Speed up R: c functions with R
● Speed up R: MP with R
● Large memory and out-of-memory data
● R in parallel: implicit parallelism
● R in parallel: explicit parallelism
● R in parallel: GPUs
● R in parallel: parallel backend
● R in parallel: foreach
● R in parallel: foreach with combine option
● R in parallel: foreach and combine
● R in parallel: foreach and iterator
● R in parallel: foreach and parallel execution
● R in parallel: combine option
● R in parallel: parallel
● R in parallel: mcparallel()
● R in parallel: parallel backend, doMC
● R in parallel: doMC
● R in parallel: doMC for randomForest
● R in parallel: applyKernel
● R in parallel: Rmpi installation
● R in parallel: Rmpi
● R in parallel: doMPI
● R in parallel: Rmpi functions
● R in parallel: doMPI
● R in parallel: doMPI/foreach/.csv
● R in parallel: Rmpi
● R in parallel: Rmpi and snow
● R in parallel: Rmpi svd, initalization
● R in parallel: Rmpi svd data
● R in parallel: Rmpi svd, slave function
● R in parallel: Rmpi svd start slaves
● R in parallel: Rmpi svd send tasks
● R in parallel: Rmpi svd results
● R in parallel: Rmpi slurm batch job
● R in parallel: Rmpi example
● Managing software packages: Modules
● Installation examples: gdal for R/gromacs
● R installation: an example

نوع زبان: انگلیسی حجم: 0.55 مگا بایت
نوع فایل: اسلاید پاورپوینت تعداد اسلایدها: 83 صفحه
سطح مطلب: نامشخص پسوند فایل: pptx
گروه موضوعی: زمان استخراج مطلب: 2019/06/15 11:03:46

لینک دانلود رایگان لینک دانلود کمکی

اسلایدهای پاورپوینت مرتبط در پایین صفحه

عبارات مهم استفاده شده در این مطلب

عبارات مهم استفاده شده در این مطلب

., r, vector, element, c, stanford, list, zhang, function, zhiyong, name, university,

توجه: این مطلب در تاریخ 2019/06/15 11:03:46 به صورت خودکار از فضای وب آشکار توسط موتور جستجوی پاورپوینت جمع آوری شده است و در صورت اعلام عدم رضایت تهیه کننده ی آن، طبق قوانین سایت از روی وب گاه حذف خواهد شد. این مطلب از وب سایت زیر استخراج شده است و مسئولیت انتشار آن با منبع اصلی است.

https://srcc.stanford.edu/sites/g/files/sbiybj10261/f/r_tutorial_11112016.pptx

در صورتی که محتوای فایل ارائه شده با عنوان مطلب سازگار نبود یا مطلب مذکور خلاف قوانین کشور بود لطفا در بخش دیدگاه (در پایین صفحه) به ما اطلاع دهید تا بعد از بررسی در کوتاه ترین زمان نسبت به حدف با اصلاح آن اقدام نماییم. جهت جستجوی پاورپوینت های بیشتر بر روی اینجا کلیک کنید.

عبارات پرتکرار و مهم در این اسلاید عبارتند از: ., r, vector, element, c, stanford, list, zhang, function, zhiyong, name, university,

مشاهده محتوای متنیِ این اسلاید ppt

مشاهده محتوای متنیِ این اسلاید ppt

harnessing the power of high performance computing for r stanford research computing center research computing support@stanford.edu zhiyong zhang zyzhang@stanford.edu zhiyong zhang stanford university shared memory v.s. distributed memory zhiyong zhang stanford university ۲ ۲ ۲ r hpc matters most r packages use a single core. vectorization and other optimizations in r interfaces for compiled code profiling tools memory and cpu large memory and out of memory data parallelism for r threads or shared memory limited to one node implicit minor changes if at all required explicit some assembly required mpi sockets or distributed memory one or more nodes explicit only r with accelerator xeon phi coprocessors gpu accelerators zhiyong zhang stanford university ۳ ۳ ۳ r in parallel r basics .rprofile .renviron file.path getwd .rprofile r libs r home r home dir r libs user zyzhang@sherlock ln ۲ ~ r rhome share sw free r ۳.۲. lib۶۴ r zyzhang@sherlock ln ۲~ rscript script name.r zyzhang@sherlock ln ۲~ r cmd batch script name.r zyzhang@sherlock ln ۲ ~ r source script name install.packages pkg remove.packages pkg help solve example solve command name or command name ls pos package rmpi .packages path.package rmpi installed.packages .libpaths .library zhiyong zhang stanford university ۴ ۴ ۴ useful r commands and variables help fctn displays help on any function fctn as in python. to invoke complex arithmetic add i to a number. for example sqrt ۱ returns nan but sqrt ۱ i returns ۱i. sessioninfo prints the r version os packages loaded etc. ls shows which objects are defined. rm list ls clears all defined objects. dev.new opens a new plotting window. the function sort does not change its argument. distribution function prefixes d p q r stand for density pdf probability cdf quantile cdf ۱ and random sample. dnorm is the density function of a normal random variable and rnorm generates a sample from a normal random variable. dunif and runif corresponding functions for a uniform random variable. zhiyong zhang stanford university ۵ ۵ ۵ useful r commands and variables assignment e m c^۲. m c^۲ e. must use for default function arguments or named arguments. not reserved but better treated as c q s t c d f i and t. comments comments begin with and continue to the end of the line as in python or perl. missing values and nan nan not a number. overflows undefined operation such as dividing by zero. na not applicable. missing data or null value. na is a legal value inside an r vector and vectors received by r functions may contain non null components. r functions must handle na values. is.nan returns true for nan. is.na return true for na or nan. zhiyong zhang stanford university ۶ ۶ ۶ useful r commands and variables vectors a vector in r is a container vector an ordered collection of numbers. the length of a vector is the number of elements in the container. operations are applied componentwise. r allows adding two vectors of different lengths elements of the shorter summand are recycled as often as necessary to create a vector the length of the longer summand. scalars are vectors of length ۱ vectors are created using the c function p c ۲ ۳ ۵ ۷ vectors in r are indexed starting with ۱ and matrices are in column major order. elements of a vector can be accessed using . vectors expand when assigning to indexes past the end of the vector. negative indices x n returns a copy of x with the nth element removed. boolean values can also be used as indices five kinds of subscripts in r. the type of a vector is the type of the elements it contains. all elements of a vector must have the same underlying type logical integer double complex character or raw. zhiyong zhang stanford university ۷ ۷ ۷ useful r commands and variables lists lists are like vectors except elements need not all have the same type integer string or a vector of boolean values. lists are created using the list function. elements can be access by position using . named elements may be accessed either by position or by name. named elements of lists act like c structs except a dollar sign rather than a dot is used to access elements. a list name joe ۴ foo c ۳ ۸ ۹ now a ۱ and a name both equal the string joe . access a non existent element of a list say a ۴ above generates an error. assignment to a non existent element of a list extends the list. if the index assigned to is more than one past the end of the list intermediate elements are created and assigned null values. assignment to non existent named fields such as saying a baz true. zhiyong zhang stanford university ۸ ۸ ۸ useful r commands and variables sequences seq a b n creates a closed interval from a to b in steps of size n. seq a b length n sequence with n points and step size b a n ۱ . seq ۱ ۱ ۳ returns the vector containing ۱ ۴ ۷ and ۱ . the step size argument n defaults to ۱ in both r and python. a b is an abbreviation for seq a b ۱ . matrices matrices in r are vectors of multiple dimensions m array c ۱ ۲ ۳ ۴ ۵ ۶ dim c ۲ ۳ creates a matrix m. r fills matrices by column the first row of m has elements ۱ ۳ and ۵. to fill m by row m array c ۱ ۲ ۳ ۴ ۵ ۶ dim c ۲ ۳ by.row true . zhiyong zhang stanford university ۹ ۹ ۹ useful r commands and variables type conversion functions as.xxx converts its argument to type xxx. as.integer ۳.۲ returns the integer ۳ as.character ۳.۲ returns the string ۳.۲ . boolean operators t or true for true values f or false for false values. and apply element wise on vectors. and are often used in conditional statements and use lazy evaluation as in c the operators will not evaluate their second argument if the return value is determined by the first argument. zhiyong zhang stanford university ۱ ۱ ۱ useful r commands and …

کلمات کلیدی پرکاربرد در این اسلاید پاورپوینت: ., r, vector, element, c, stanford, list, zhang, function, zhiyong, name, university,

این فایل پاورپوینت شامل 83 اسلاید و به زبان انگلیسی و حجم آن 0.55 مگا بایت است. نوع قالب فایل pptx بوده که با این لینک قابل دانلود است. این مطلب برگرفته از سایت زیر است و مسئولیت انتشار آن با منبع اصلی می باشد که در تاریخ 2019/06/15 11:03:46 استخراج شده است.

https://srcc.stanford.edu/sites/g/files/sbiybj10261/f/r_tutorial_11112016.pptx

  • جهت آموزش های پاورپوینت بر روی اینجا کلیک کنید.
  • جهت دانلود رایگان قالب های حرفه ای پاورپوینت بر روی اینجا کلیک کنید.

رفتن به مشاهده اسلاید در بالای صفحه


پاسخی بگذارید

نشانی ایمیل شما منتشر نخواهد شد. بخش‌های موردنیاز علامت‌گذاری شده‌اند *